论文致谢查重在一定程度上会影响学术研究的深入性。首先，致谢部分是作者对于论文撰写过程中得到支持与帮助的感谢，若因查重而修改致谢内容，可能导致作者真实感谢对象被遗漏或变更，从而影响论文的真实性。其次，致谢查重可能引发作者对于论文内容的审查与修改，若修改过于频繁或过度，可能导致原本的学术思路和研究重心被打乱，影响学术研究的深入性。

然而，论文致谢查重并不是完全无益的。合理的致谢查重可以帮助作者发现论文中存在的不当引用、抄袭等问题，促进论文的规范与完整性。因此，在进行致谢查重时，作者应当保持审慎与谨慎，确保修改不影响论文的学术质量和深入性。